金银花提取物抗菌范围较广，对金黄色葡萄球菌、溶血链球菌、肺炎双球菌、百日咳杆菌等革兰氏阳性菌有抑制作用，并对志贺氏痢疾杆菌、伤寒杆菌、副伤寒杆菌、霍乱弧菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、人型结核杆菌、脑膜炎双球菌等革兰氏阴性菌也有较强的抑制作用，对钩端螺旋体也有效。本品水煎剂对多种皮肤真菌如堇色毛癣菌、许兰氏黄癣菌、铁锈色小芽孢癣菌、红色表皮癣菌、星形奴卡氏菌等有体外抑制作用。近有研究表明，金银花对引起口腔疾病的常见致病菌变形链球菌、放线粘杆菌、牙龈类杆菌、产黑色素类杆菌等均有抗菌作用。

金银花或其复方，对呼吸道病毒如流行性感冒亚洲甲型、孤儿病毒有抑制作用，且能抑制和延缓其致细胞病变的作用。此外，对疱疹病毒也有一定的抑制效果。一般认为其主要有效成分为氯原酸类化合物。